SMARTer? ThruPLEX? Plasma-Seq Kit：cfDNA

Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit

Code No.? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 產(chǎn)品名稱
R400679 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400680 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400681 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400682 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit

降解
? 包含單體，二聚體，三聚體的核小體DNA
? 成分和產(chǎn)量高度可變（病人和疾病相關(guān)）
? 小分子，分子大?。?70 bp ）

高品質(zhì)的游離DNA (cell free DNA) NGS文庫構(gòu)建
SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
· 專為cfDNA設(shè)計(jì)：經(jīng)過優(yōu)化的修復(fù)及連接試劑
· 高品質(zhì)NGS文庫：高的文庫多樣性，在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測再現(xiàn)性
· 起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速簡便：1個反應(yīng)管、2小時、3步反應(yīng)的簡單操作，無需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟
· 應(yīng)用領(lǐng)域：液態(tài)活檢、ctDNA、目標(biāo)區(qū)域測序等領(lǐng)域文庫構(gòu)建
· 兼容自動化平臺：Beckman FXP Workstation

■?產(chǎn)品說明：
SMARTer ThruPLEX Plasma-seq Kit基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫構(gòu)建。該試劑已針對cfDNA 進(jìn)行了專門優(yōu)化，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，盡可能的提升了文庫的復(fù)雜度。文庫可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect and Roche NimbleGen SeqCap EZ。
SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要單獨(dú)購買。
使用SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq試劑盒制備的文庫，提供了更高的靈敏度，可以更好地了解血漿樣本中基因變異結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價值高的特點(diǎn)，在某些研究領(lǐng)域，如對腫瘤學(xué)的轉(zhuǎn)化研究或者對孕婦血漿中胎兒游離DNA 的發(fā)育學(xué)研究，深受科研工作者的重視。

兼容主要靶標(biāo)富集平臺：Agilent SureSelect?, Roche Nimblegen? SeqCap? EZ, 和 IDT xGen? Lockdown? probes

兼容Beckman Biomek FXP ：需要與Beckman聯(lián)絡(luò)獲得流程和scripts

Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit

主要應(yīng)用：

全基因組測序，外顯子測序，靶向測序

Takara&Clontech NGS系列制品，SMARTer? ThruPLEX? Plasma-Seq：cfDNA分析

SMARTer DNA HT dual index kits
SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera??XT v2 index序列對應(yīng)的index引物，最多可提供384種不同的雙端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。其中index引物預(yù)先分裝在4個不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中，每個微孔板可提供不同的96種index組合（Code No.R400660-R400663），index微孔板（96N Sets A-D）的每個孔提供的量足夠進(jìn)行一次測序反應(yīng)；另一種是一套中有24個單獨(dú)的反應(yīng)管，每個反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664），且每個反應(yīng)管（24N）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng)。

SMARTer DNA unique dual index kits
SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對應(yīng)的index引物，最多可提供96種不同雙端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個單獨(dú)的管中，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）。每個index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng)。

SMARTer DNA single index kits
SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對應(yīng)的index引物，可提供24種單端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個單獨(dú)的管中，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）。每個index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進(jìn)行8次測序反應(yīng)。