人誘導(dǎo)多能干細胞(Human induced pluripotent stem cells,hiPSCs)是一個功能強大的研究工具和疾病模型,因為其具備增殖、自我更新、分化為多種細胞類型的能力。此外,人iPS細胞還可以再現(xiàn)細胞來源個體的疾病表型和基因型。將人iPS細胞結(jié)合基于CRISPR/Cas9的基因編輯技術(shù),可以在同基因的細胞系中研究特定基因改變引起的功能影響,因為基因編輯過的人iPS細胞能提供可再生的、無遺傳變異的患病細胞和健康細胞資源。
CRISPR/Cas9系統(tǒng)已經(jīng)成為一個強大的基因編輯工具,因為其高的靶向特異性,編輯效率和易用性。該技術(shù)的強大主要源于它的簡單,因為全部只需要一個Cas9核酸酶結(jié)合一個單鏈向?qū)NA(single guide RNA,sgRNA) 就可以決定靶向特異性(Jinek et al. 2012)。這種RNA編程的(RNA-programmable)方法利用了非同源末端連接(non-homologous end joining,NHEJ) DNA修復(fù)途徑的易錯特性,進而產(chǎn)生基因敲除(通過插入/刪除)。這種方法也可以通過同源重組(homology-directed repair,HDR)途徑被用于基因敲入。
CRISPR/Cas9系統(tǒng)的組件可以通過多種方法成功導(dǎo)入至靶細胞,包括基于載體的表達系統(tǒng),RNA轉(zhuǎn)染, 導(dǎo)入Cas9/sgRNA核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)復(fù)合物(Sander and Joung 2014)等。與基于載體的方法相比,直接導(dǎo)入Cas9/sgRNA RNPs提供了一種快速轉(zhuǎn)入基因編輯實驗的方法,同時脫靶效應(yīng)的可能性更?。↘im et al. 2014)。
一旦Cas9/sgRNA RNP復(fù)合物被導(dǎo)入,為了分離和篩選感興趣的基因型,單細胞必須被分離并擴增為克隆細胞系。傳統(tǒng)上,從基因編輯的hiPS細胞建立一個克隆群是低效的、具有挑戰(zhàn)性的和耗時的,因為hiPS 細胞是以集落生長和傳代的。通常,這會導(dǎo)致細胞死亡和提前分化。然而,Cellartis單細胞克隆系統(tǒng)包含一個成分確定的培養(yǎng)系統(tǒng)(由基礎(chǔ)培養(yǎng)基,包被劑,和添加劑組成),用于有效形成單細胞克隆和擴增基因編輯后的hiPSC克隆。DEF-CS culture system (Asplund et al. 2016)是一個基于單層培養(yǎng)的系統(tǒng),規(guī)避了集落狀培養(yǎng)帶來的挑戰(zhàn),允許單細胞傳代和促進接種的單細胞存活和后續(xù)擴增。
關(guān)聯(lián)基因編輯系統(tǒng):
一、電穿孔法基因編輯
通過電穿孔的方法對hiPSCs進行有效的基因編輯,Takara提供重組Cas9蛋白質(zhì)和產(chǎn)生大量sgRNAs所有必要的試劑,用于電穿孔hiPSCs。后續(xù)與Cellartis iPSC Single-Cell Cloning DEF-CS Culture Media Kit (Code No. Y30021)一起使用,用于進行基因編輯后的單細胞克隆形成和擴增。單細胞克隆擴增后,hiPSCs可以使用Cellartis DEF-CS 500 Culture System (Code No. Y30010)繼續(xù)培養(yǎng)。
二、Gesicle法基因編輯
Gesicles法是一種無毒的、高效的、替代電穿孔的方法,不依賴昂貴的設(shè)備或耗材。通過Gesicle法導(dǎo)入Cas9/sgRNA復(fù)合物進行有效的基因編輯,Takara提供所有的必要試劑用于產(chǎn)生細胞衍生的納米囊泡(Gesicles),來轉(zhuǎn)導(dǎo)Cas9和sgRNA至hiPSCs。后續(xù)可與Cellartis iPSC Single-Cell Cloning DEF-CS Culture Media Kit (Code No. Y30021)一起使用,用于進行基因編輯后的單細胞克隆形成和擴增。單細胞克隆擴增后,hiPSCs可以使用Cellartis DEF-CS 500 Culture System (Code No. Y30010)繼續(xù)培養(yǎng)。
產(chǎn)品名稱:Takara Cellartis授權(quán)代理 人iPS細胞基因編輯和單細胞克隆系統(tǒng)
產(chǎn)品貨號:Y30021
產(chǎn)品規(guī)格:1 kit
產(chǎn)品產(chǎn)地:日本
產(chǎn)品品牌:Takara Cellartis
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