CleanNGS Kit
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CleanNGS核酸提取磁珠
品牌:荷蘭CleanNA
英文名稱:CleanNGS Kit
中文名稱:CleanNGS核酸純化磁珠
用途:NGS文庫/PCR產(chǎn)物純化 DNA\RNA核酸片段篩選
貨號:CNGS-0005/CNGS-0050/CNGS-0500
規(guī)格:5 mL/50 mL/500 mL
CleanNGS核酸提取磁珠與知名品牌AMPureXP操作規(guī)程和結果無明顯差異,但價格更低。
CleanNGS磁珠可以通過調節(jié)磁珠和核酸樣本體積比,輕松進行核酸片段篩選。
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CleanNGS核酸提取磁珠優(yōu)勢:
1. 優(yōu)異的緩沖體系,100bp以上擴增產(chǎn)物回收效率更高;
2. 有效去除dNTP、引物、引物二聚體、鹽離子和其他雜質;
3. 可進行核酸大小篩選。
3. 磁珠磁含量更高,磁吸附時間更短;
4. 無RNA酶的生產(chǎn)過程確保能應用于各種RNA的提取操作;
5. 可配套自動化設備進行高通量產(chǎn)物純化。
6. 與知名品牌AMPureXP操作規(guī)程和結果無明顯差異,但價格更低。
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CleanNGS核酸提取磁珠試劑盒使用羧化磁珠提取DNA、RNA,為新一代測序(NGS)流程提供了高效的純化系統(tǒng)。?CleanNGS試劑盒具有最大的靈活性,只要調節(jié)樣品和CleanNGS磁珠的體積比,可以輕松進行核酸左側,右側或雙側大小篩選。
CleanNGS使DNA和/或RNA核酸片段根據(jù)其大小選擇性地結合到磁珠上,同時根據(jù)化學性質去除鹽,引物,引物二聚體和dNTP。提取的DNA和RNA使用水或低鹽緩沖液洗脫磁珠,并且可以直接用于下游應用等。CleanNGS可以手動使用,也可以適用于您當前的液體處理工作站所用方法(例如Hamilton,Beckman,Agilent,Caliper,Perkin Elmer,Tecan和Eppendorf)。
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應用:
CleanNGS系統(tǒng)提取的產(chǎn)物是用水洗脫的,可立即用于下游應用:
新一代測序文庫、PCR產(chǎn)物純化
基因組DNA提取、RNA提取
片段分析、微陣列、限制性酶純化、克隆
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CleanNGS DNA/RNA提取磁珠可配套的液體工作站:
Beckman FX, Beckman NX ,Hamilton Microlab Star,Hamilton StarLET,Xiril Neon Instruments,Caliper Sciclone,Thermo KingFisher BioSprint (Qiagen) Ambion MagMax 96,Perkin Elmer Janus,Agilent Bravo等。
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工作原理:
羧化磁珠
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CleanNGS采用羧化磁珠,可以特異性結合核酸,非特異性洗脫。相比硅基磁珠,非特異性結合更少,產(chǎn)量更高,更具有專有性。
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試劑盒組份
CleanNGS羧基化磁珠,含于PCR結合緩沖液中
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使用自備材料
?乙醇 ?CleanNA環(huán)形磁鐵板 ?用于DNA洗脫的TE或試劑級水
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操作流程:
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PCR產(chǎn)物純化流程(上圖)
1 添加CleanNGS和Mix以將NGS文庫片段或PCR產(chǎn)物結合到磁珠上。
2 將磁珠磁化以將樣品與雜質分離。吸出含雜質溶液。
3 加入70%乙醇清洗磁珠。磁珠磁化。吸出乙醇。重復步驟。
4 加入水從磁珠上洗脫DNA。磁珠磁化并提取純化的PCR產(chǎn)物。
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核酸片段篩選流程(上圖)
1.添加第一份CleanNGS到文庫中以結合大片段
2.用磁鐵將磁珠從溶液中分離出來
3.將含有較小片段的上清液轉移到干凈的微孔中
4.添加第二份CleanNGS到上清液中以結合目標大小片段
5.用磁鐵將磁珠從溶液中分離出來,吸出并丟棄含雜質的上清液
6.用80%乙醇清洗珠子
7.加入水以從珠上洗脫DNA。使用磁鐵分離磁珠,并提取純化和經(jīng)過大小篩選的DNA核酸片段。
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核酸片段篩選舉例:0.8x / 0.7x(左/右)片段篩選,樣品量50μL
?第一步:
添加0.7 x 50μL= 35μLCleanNGS
將大片段結合到磁珠上
結合和分離后轉移上清液
?第二步:
將(0.8-0.7)x 50μL= 5μL CleanNGS加入上清液
將感興趣的片段結合到新一組的磁珠上
吸出并棄上清液(含有最小的片段)
清洗并洗脫經(jīng)片段篩選的DNA
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第一步:
添加0.7 x 50μL= 35μLCleanNGS
將大片段結合到磁珠上
結合和分離后轉移上清液
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第二步:
將(0.8-0.7)x 50μL= 5μL CleanNGS加入上清液
將感興趣的片段結合到新一組的磁珠上
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吸出并棄上清液(含有最小的片段)
清洗并洗脫經(jīng)大小片段篩選的DNA
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