ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit
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Rubicon Genomics R400584 ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit? 12Rxns
Rubicon Genomics R400585 ThruPLEX Tag-seq 48S Kit? ? ? ? ? ?48Rxns
Rubicon Genomics R400586 ThruPLEX Tag-seq 96D Kit? ? ? ? ? ?96Rxns
構(gòu)建帶有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文庫(kù)
ThruPLEX? Tag-seq Kit
???提供可信的變異檢測(cè)分析。
???結(jié)構(gòu)變異。
???污染發(fā)生。
???研究結(jié)果。
???ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多種樣品類型。
■ 產(chǎn)品說(shuō)明:
ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫(kù)。每個(gè)試劑盒包含超過(guò)1,600萬(wàn)個(gè)特別序列用于在擴(kuò)增前標(biāo)記每條DNA片段,可以在文庫(kù)制備、目標(biāo)富集和數(shù)據(jù)分析過(guò)程中追蹤DNA片段,以檢測(cè)低豐度等位基因或計(jì)數(shù)獨(dú)立片段。采用ThruPLEX 技術(shù)設(shè)計(jì)及優(yōu)化,可以1到50 ng DNA起始構(gòu)建高多樣性、高重復(fù)性文庫(kù)。整個(gè)流程在單管或單孔中就可完成,只需3步,2小時(shí),無(wú)需中間純化步驟和樣品轉(zhuǎn)移,避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標(biāo)記96個(gè)樣品的檢索引物。純化和定量后,文庫(kù)可以采用標(biāo)準(zhǔn)Illumina測(cè)序試劑和流程在Illumina NGS平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。
圖1. 單管,三步操作流程。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始構(gòu)建檢索引物文庫(kù)只需3步:末端修復(fù),接頭連接和高保真文庫(kù)擴(kuò)增。無(wú)需純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。簡(jiǎn)化的工作流程,在單管或單孔中2個(gè)小時(shí)即可完成,避免樣品損失,增強(qiáng)了陽(yáng)性識(shí)別。
圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA或游離DNA起始,只需3步反應(yīng),簡(jiǎn)單高效。
圖3. 減少背景,結(jié)果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫(kù)。Agilent SureSelect富集目標(biāo)區(qū)域,~5,000X覆蓋度測(cè)序,采用Curio Genomics生物信息學(xué)平臺(tái)分析數(shù)據(jù)。采用原始數(shù)據(jù)分析,EGFR 的突變(黃色點(diǎn))會(huì)被背景誤差遮蓋(左圖)。而在數(shù)據(jù)分析過(guò)程中使用UMT修正誤差,突變更容易識(shí)別(右圖)。
圖4. 顯著提高信噪比,發(fā)現(xiàn)更多。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫(kù),240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標(biāo)區(qū)域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測(cè)序。Curio Genomics生物信息學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
*數(shù)據(jù)來(lái)源于Takara Bio Inc.
■ 產(chǎn)品組成
自備試劑:
熱循環(huán)儀(推薦使用實(shí)時(shí)儀器)
離心分離機(jī)
PCR管或96孔PCR板和密封件
低吸附濾芯槍頭
新鮮制備的80%(v / v)乙醇
Agencourt?XP核酸純化磁珠(Beckman Coulter,目錄號(hào)A63880)
■ 保存
-20℃
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