Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX WGA Kit單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒
華雅思創(chuàng)生物現(xiàn)貨供應(yīng)
【產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)】
1.可再生的單個(gè)細(xì)胞的結(jié)果(或< 15 pg DNA)
2.優(yōu)越的再現(xiàn)性等位基因的表示
3.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒易于使用和自動(dòng)化
4.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒在所有分辨率、微陣列和PCR上都有明確的結(jié)果
【產(chǎn)品應(yīng)用】
研究領(lǐng)域
PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒的適用范圍十分廣泛,多種原始材料和微量樣品均可通過(guò)該試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增,
•生物標(biāo)志物研究(CNVs、SNVs)
•體外受精胚胎植入前基因測(cè)序
•轉(zhuǎn)基因動(dòng)物基因分型
•胚胎和干細(xì)胞研究
•單精子分型 腫瘤
•體細(xì)胞遺傳變異分析
•腫瘤進(jìn)化和發(fā)展
•腫瘤干細(xì)胞
•循環(huán)腫瘤細(xì)胞 細(xì)菌
•宏基因組學(xué)研究
•微生物基因分型
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒可實(shí)現(xiàn)高度均一的全基因組擴(kuò)增,其核心技術(shù)為多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增(MALBAC)技術(shù),該技術(shù)利用獨(dú)特的具有鏈置換活性的DNA聚合酶進(jìn)行準(zhǔn)線性的全基因組預(yù)擴(kuò)增,通過(guò)PCR進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增,為下游分析提供充分的實(shí)驗(yàn)材料。
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒解決了單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增的其中幾個(gè)必要的矛盾:
1. 線性擴(kuò)增。如果用全基因組PCR擴(kuò)增,因?yàn)镻CR的擴(kuò)增偏向性,再加上PCR過(guò)程中較小的偏向性通過(guò)指數(shù)放大,其結(jié)果就會(huì)是嚴(yán)重的覆蓋不均一,導(dǎo)致在許多地方只有很低的覆蓋、甚至沒(méi)有覆蓋。所以,保證模板被線性地?cái)U(kuò)增,是首要問(wèn)題。
2. 全基因組覆蓋。常規(guī)的建庫(kù)方法,因?yàn)檠a(bǔ)平、加A、接頭連接效率的問(wèn)題,起始DNA中有很大一部分會(huì)被浪費(fèi),沒(méi)有形成有效文庫(kù)分子(也就是兩頭都接好引物的DNA片段)。在單細(xì)胞測(cè)序中,這是不可接受的。
3. 高擴(kuò)增效率。單細(xì)胞中的每個(gè)基因位置理論上都只有2個(gè)拷貝,而要從2個(gè)拷貝擴(kuò)增到足夠建立文庫(kù)的DNA量,要經(jīng)過(guò)許多次的擴(kuò)增。這就需要很高的擴(kuò)增效率。而一般的線性擴(kuò)增很難有好的擴(kuò)增效率
我們的PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒與MALBAC其技術(shù)原理一樣,
MALBAC™技術(shù)(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles),即多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增技術(shù),為一種單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù),先利用獨(dú)特的具有鏈置換活性的DNA聚合酶進(jìn)行準(zhǔn)線性的全基因組預(yù)擴(kuò)增,再通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增,為下游分析提供充足的實(shí)驗(yàn)材料。
MALBAC™技術(shù)源于哈佛大學(xué),其專利全球唯一指定授權(quán)給億康基因,是目前世界上最先進(jìn)的單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù),使用該技術(shù)的相關(guān)論文發(fā)表于頂級(jí)科學(xué)期刊《Cell》、《Science》、《PNAS》等。使用該技術(shù),科學(xué)家們完成了迄今覆蓋度最高的單精子基因圖譜,首次對(duì)人類單個(gè)卵細(xì)胞完成了測(cè)序。Science雜志評(píng)選單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)為2013年最具發(fā)展前景的六大科學(xué)項(xiàng)目之一,Nature Methods也將其選為Method of the Year 2013。
MALBAC技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1) MALBAC技術(shù)降低PCR擴(kuò)增偏倚,使得單細(xì)胞中最大90%以上的基因組能夠被測(cè)序。
2) MALBAC技術(shù)使得檢測(cè)單細(xì)胞中較小的DNA序列變異變得更容易,因此能夠發(fā)現(xiàn)個(gè)別細(xì)胞之間的遺傳差異。這樣的差異可以幫助解釋癌癥惡化的機(jī)制,生殖細(xì)胞形成機(jī)制,甚至是個(gè)別神經(jīng)元的差異機(jī)制。
3) 靈敏度高:?jiǎn)渭?xì)胞、單染色體或0.5pg的基因組DNA即可進(jìn)行擴(kuò)增。
4) MALBAC技術(shù)擴(kuò)增均勻性顯著優(yōu)于其它同類技術(shù),低覆蓋度測(cè)序數(shù)據(jù)即可進(jìn)行CNV分析,用于染色體三體檢測(cè)及染色體微缺失變異檢測(cè)。
5) 擴(kuò)增產(chǎn)物用途廣泛:可用于二代測(cè)序、微陣列、qPCR、基因克隆等下游應(yīng)用。
MALBAC™引領(lǐng)學(xué)術(shù)突破性進(jìn)展:
1.在國(guó)際頂尖雜志發(fā)表文章:Science 、Cell 、PNAS、Annual Review等
2.嚴(yán)格驗(yàn)證MALBAC技術(shù)用于PGS的文章發(fā)表于ASRM(美國(guó)生殖醫(yī)學(xué)學(xué)會(huì))會(huì)刊
3.首次完成人類單個(gè)卵細(xì)胞的測(cè)序
4.完成迄今覆蓋度最高的單精子基因圖譜
5.全球首個(gè)無(wú)創(chuàng)植入前染色體篩查寶寶誕生,相關(guān)成果發(fā)表于《PNAS》
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒其原理:
PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒通過(guò)擴(kuò)增產(chǎn)物的末端自封閉來(lái)抑制指數(shù)擴(kuò)增。 •
PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒通過(guò)數(shù)輪線性擴(kuò)增得到大量的擴(kuò)增產(chǎn)物
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【研究領(lǐng)域】
1. 外顯子組富集
2. SureSelect® 富集
3. SeqCap® EZ 富集
4. 福爾馬林固定石蠟包埋DNA測(cè)序
5. 胚胎植入前遺傳學(xué)篩查(PGS)/種植前遺傳學(xué)診斷(PGD)
6. DNA測(cè)序
7. RNA測(cè)序
8. 染色體免疫共沉淀測(cè)序
產(chǎn)品名稱 |
平臺(tái) |
應(yīng)用程序 |
樣本 |
樣本量 |
技術(shù) |
ThruPLEX®DNA-seq Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向測(cè)序, 染色體免疫共沉淀測(cè)序, 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 |
FFPE DNA, gDNA, cDNA, |
50 pg – 50 ng |
高靈敏度基于連接的擴(kuò)增 |
ThruPLEX®-FD Prep Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向測(cè)序,ctDNA分析 |
Cell-free DNA isolated from plasma |
<1 ng – 30 ng |
高靈敏度基于連接的擴(kuò)增 |
PicoPLEX™ |
Illumina NGS |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60pg |
準(zhǔn)隨機(jī)引物線性擴(kuò)增 |
PicoPLEX™ |
陣列, |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60 pg DNA |
準(zhǔn)隨機(jī)引物線性擴(kuò)增 |
TransPLEX®C-WTA Kit |
陣列, |
基因表達(dá)分析 |
RNA |
10 – 300 ng RNA |
準(zhǔn)隨機(jī)引物擴(kuò)增 |
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